Uma transportadora, além dos serviços de transporte, tem em seu cadastro o CNAE de armazenamento, depósito, carga, descarga, arrumação e guarda de bens. Contudo, emite tão somente notas fiscais de serviço de transporte, declarando nas gias de ICMS as CFOPs 1905 e 5905. Este contribuinte não teria que emitir notas fiscais de serviços correlacionados ao subitem 11.04? Como poderia conduzir esta auditoria e cruzar tais informações?

Só pelo fato de constar tais atividades no cadastro da empresa, não significa que ela tenha que exercer todas elas no momento.

É legal exercer tão somente o transporte. Não há qualquer irregularidade nisso.

Solicite os livros contábeis e os contratos da empresa com seus clientes para confirmar se a empresa realmente não executa as demais atividades.

Outra alternativa é consultar as redes sociais do contribuinte e apurar os produtos oferecidos por ele.